Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms