Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms