Protein–RNA interactions for Protein: Q17RQ9

NKPD1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKPD1Q17RQ9 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NKPD1Q17RQ9 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NKPD1Q17RQ9 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NKPD1Q17RQ9 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NKPD1Q17RQ9 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NKPD1Q17RQ9 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NKPD1Q17RQ9 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NKPD1Q17RQ9 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NKPD1Q17RQ9 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NKPD1Q17RQ9 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NKPD1Q17RQ9 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NKPD1Q17RQ9 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NKPD1Q17RQ9 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NKPD1Q17RQ9 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NKPD1Q17RQ9 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NKPD1Q17RQ9 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NKPD1Q17RQ9 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NKPD1Q17RQ9 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NKPD1Q17RQ9 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NKPD1Q17RQ9 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NKPD1Q17RQ9 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NKPD1Q17RQ9 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NKPD1Q17RQ9 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NKPD1Q17RQ9 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms