Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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