Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms