Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms