Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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