Protein–RNA interactions for Protein: Q15404

RSU1, Ras suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSU1Q15404 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RSU1Q15404 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RSU1Q15404 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RSU1Q15404 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RSU1Q15404 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms