Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.724e-8■■■□□ 15.8
PCBP2Q15366 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.184e-8■■■□□ 15.8
PCBP2Q15366 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.034e-8■■■□□ 15.8
PCBP2Q15366 RTKN-210ENST00000492013 853 ntTSL 212.34□□□□□ -0.433e-13■■■□□ 15.8
PCBP2Q15366 SPPL2B-205ENST00000589515 1733 ntTSL 519.96■□□□□ 0.798e-7■■■□□ 15.8
PCBP2Q15366 CDH2-203ENST00000413878 563 ntTSL 413.35□□□□□ -0.272e-6■■■□□ 15.8
PCBP2Q15366 CDH2-201ENST00000269141 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.72e-6■■■□□ 15.8
PCBP2Q15366 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.251e-8■■■□□ 15.8
PCBP2Q15366 ASPSCR1-216ENST00000583503 641 ntTSL 316.46■□□□□ 0.232e-13■■■□□ 15.8
PCBP2Q15366 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.342e-6■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 CTDSP1-214ENST00000497677 998 ntTSL 215.04■□□□□ -02e-6■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 CTDSP1-205ENST00000452977 818 ntTSL 514.35□□□□□ -0.112e-6■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 CTDSP1-212ENST00000494067 362 ntTSL 312.39□□□□□ -0.432e-6■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 SDR39U1-221ENST00000556707 1196 ntTSL 223.38■■□□□ 1.335e-10■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.885e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.815e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 FAM219A-208ENST00000422409 798 ntTSL 220.1■□□□□ 0.815e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 SDR39U1-204ENST00000553343 681 ntTSL 219.81■□□□□ 0.765e-10■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 SDR39U1-210ENST00000555225 769 ntTSL 318.04■□□□□ 0.485e-10■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.485e-10■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 SDR39U1-219ENST00000556523 735 ntTSL 316.13■□□□□ 0.175e-10■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 SDR39U1-217ENST00000556249 556 ntTSL 314.99□□□□□ -0.015e-10■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.035e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.15e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.135e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.255e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 SDR39U1-211ENST00000555355 934 ntTSL 213.43□□□□□ -0.265e-10■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.275e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.325e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 PRR13-211ENST00000551365 1375 ntTSL 312.74□□□□□ -0.371e-9■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 SDR39U1-214ENST00000555778 608 ntTSL 212.74□□□□□ -0.375e-10■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 PRR13-212ENST00000551945 261 ntAPPRIS ALT2 TSL 37.05□□□□□ -1.281e-9■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 TRIM41-203ENST00000503114 1904 ntTSL 1 (best)18.84■□□□□ 0.612e-6■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 TRIM41-207ENST00000515223 5707 ntTSL 215.52■□□□□ 0.082e-6■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.375e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 RUNX1-216ENST00000482318 1710 ntTSL 1 (best)21.72■■□□□ 1.075e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.083e-6■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 KIAA0319L-203ENST00000426982 3213 ntTSL 512.08□□□□□ -0.483e-6■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 KIAA0319L-217ENST00000485551 4398 ntTSL 26.94□□□□□ -1.33e-6■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.516e-9■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 CYHR1-207ENST00000528558 907 ntTSL 219.97■□□□□ 0.796e-9■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.376e-9■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 CYHR1-206ENST00000526887 1012 ntTSL 316.2■□□□□ 0.186e-9■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.492e-6■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.516e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.446e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 DUS1L-203ENST00000538833 1250 ntTSL 1 (best)16.47■□□□□ 0.236e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 DUS1L-204ENST00000542088 1040 ntTSL 316.44■□□□□ 0.226e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 DUS1L-213ENST00000580731 725 ntTSL 515.71■□□□□ 0.116e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 DUS1L-209ENST00000578428 688 ntTSL 214.89□□□□□ -0.036e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 DUS1L-210ENST00000578846 4456 ntTSL 213.96□□□□□ -0.176e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 DUS1L-205ENST00000577574 473 ntTSL 513.68□□□□□ -0.226e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 DUS1L-212ENST00000579854 657 ntTSL 213.25□□□□□ -0.296e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 DUS1L-216ENST00000584871 676 ntTSL 212.52□□□□□ -0.416e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 ZNF629-201ENST00000262525 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.521e-6■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 ATXN7L3-212ENST00000593073 527 ntTSL 47.79□□□□□ -1.163e-6■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 NAP1L4-210ENST00000492685 850 ntTSL 56.61□□□□□ -1.351e-6■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 01e-6■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 PA2G4-206ENST00000552766 1085 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.651e-6■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 FCGRT-218ENST00000600273 582 ntTSL 216.19■□□□□ 0.181e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 SND1-204ENST00000465900 630 ntTSL 46.37□□□□□ -1.392e-6■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 TCF7L2-211ENST00000466338 1026 ntTSL 29.66□□□□□ -0.862e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 TCF7L2-212ENST00000470254 768 ntTSL 59.05□□□□□ -0.962e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 TCF7L2-207ENST00000369386 1274 ntTSL 57.13□□□□□ -1.272e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 TCF7L2-214ENST00000480888 182 ntTSL 5-0.34□□□□□ -2.462e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.016e-18■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 CD151-220ENST00000532045 1803 ntTSL 520.61■□□□□ 0.896e-18■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.556e-18■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.56e-18■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.356e-18■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 CD151-218ENST00000530726 1407 ntTSL 512.62□□□□□ -0.396e-18■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 CD151-205ENST00000525181 364 ntTSL 38.2□□□□□ -1.16e-18■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.431e-6■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 WDR59-214ENST00000568323 558 ntTSL 515.98■□□□□ 0.151e-6■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 WDR59-223ENST00000616369 1953 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.581e-6■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 VGLL4-206ENST00000418000 792 ntTSL 322.8■■□□□ 1.243e-6■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 VGLL4-205ENST00000417466 894 ntTSL 320.57■□□□□ 0.883e-6■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 VGLL4-218ENST00000623028 728 ntTSL 517.71■□□□□ 0.433e-6■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 VGLL4-204ENST00000417206 581 ntTSL 417.29■□□□□ 0.363e-6■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 VGLL4-209ENST00000424709 437 ntTSL 314.22□□□□□ -0.133e-6■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 VGLL4-207ENST00000419541 466 ntTSL 313.09□□□□□ -0.313e-6■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 VGLL4-215ENST00000458499 766 ntTSL 313.09□□□□□ -0.313e-6■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 VGLL4-213ENST00000445411 726 ntTSL 58.78□□□□□ -13e-6■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 VGLL4-217ENST00000480288 586 ntTSL 48.47□□□□□ -1.053e-6■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.571e-8■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 ATF7-202ENST00000456903 5218 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.94e-8■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 ARHGEF40-203ENST00000554514 2928 ntTSL 1 (best)15.4■□□□□ 0.062e-9■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 CCDC85C-201ENST00000380243 16393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.819e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.143e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 SNX6-205ENST00000555648 467 ntTSL 314.31□□□□□ -0.123e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 SNX6-206ENST00000556162 1855 ntTSL 213.59□□□□□ -0.233e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 SNX6-210ENST00000557341 559 ntTSL 513.11□□□□□ -0.313e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 SNX6-203ENST00000555416 1215 ntTSL 1 (best)12.87□□□□□ -0.353e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 SNX6-207ENST00000556303 539 ntTSL 211.77□□□□□ -0.533e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 SNX6-209ENST00000557265 725 ntTSL 311.31□□□□□ -0.63e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 SNX6-201ENST00000362031 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.743e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 SNX6-208ENST00000556712 851 ntTSL 59.76□□□□□ -0.853e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.347e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 C20orf196-203ENST00000442185 627 ntTSL 39.36□□□□□ -0.917e-7■■■□□ 15.7
PCBP2Q15366 C20orf196-204ENST00000445603 501 ntTSL 35.12□□□□□ -1.597e-7■■■□□ 15.7
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