Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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