Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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SHPRHQ149N8 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
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SHPRHQ149N8 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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SHPRHQ149N8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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SHPRHQ149N8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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SHPRHQ149N8 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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SHPRHQ149N8 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
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SHPRHQ149N8 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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SHPRHQ149N8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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SHPRHQ149N8 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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