Protein–RNA interactions for Protein: Q13885

TUBB2A, Tubulin beta-2A chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2AQ13885 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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TUBB2AQ13885 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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TUBB2AQ13885 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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TUBB2AQ13885 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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TUBB2AQ13885 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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TUBB2AQ13885 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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TUBB2AQ13885 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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TUBB2AQ13885 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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TUBB2AQ13885 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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TUBB2AQ13885 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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TUBB2AQ13885 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB2AQ13885 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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