Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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