Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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