Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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LAMB3Q13751 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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LAMB3Q13751 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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LAMB3Q13751 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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LAMB3Q13751 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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LAMB3Q13751 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMB3Q13751 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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