Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms