Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
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