Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms