Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRQ13535 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRQ13535 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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