Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TOP3AQ13472 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TOP3AQ13472 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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TOP3AQ13472 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TOP3AQ13472 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TOP3AQ13472 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TOP3AQ13472 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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TOP3AQ13472 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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TOP3AQ13472 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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TOP3AQ13472 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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