Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 LGALS14-201ENST00000360675 773 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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MKRN4PQ13434 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 VDAC1P12-201ENST00000451853 882 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 HVCN1-209ENST00000620084 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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MKRN4PQ13434 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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MKRN4PQ13434 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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MKRN4PQ13434 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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MKRN4PQ13434 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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MKRN4PQ13434 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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MKRN4PQ13434 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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MKRN4PQ13434 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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MKRN4PQ13434 AC007494.2-201ENST00000563757 764 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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MKRN4PQ13434 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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MKRN4PQ13434 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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