Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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