Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1AQ13111 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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