Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFX1Q12986 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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