Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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FOXF1Q12946 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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FOXF1Q12946 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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FOXF1Q12946 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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FOXF1Q12946 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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FOXF1Q12946 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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