Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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