Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms