Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms