Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APBA1Q02410 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms