Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms