Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTBP60709 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACTBP60709 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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