Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HIRAP54198 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIRAP54198 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HIRAP54198 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIRAP54198 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIRAP54198 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIRAP54198 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HIRAP54198 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIRAP54198 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIRAP54198 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HIRAP54198 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIRAP54198 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIRAP54198 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIRAP54198 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIRAP54198 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIRAP54198 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIRAP54198 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIRAP54198 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HIRAP54198 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIRAP54198 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIRAP54198 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIRAP54198 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIRAP54198 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIRAP54198 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIRAP54198 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIRAP54198 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIRAP54198 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIRAP54198 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIRAP54198 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIRAP54198 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIRAP54198 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIRAP54198 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIRAP54198 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HIRAP54198 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HIRAP54198 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HIRAP54198 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIRAP54198 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HIRAP54198 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIRAP54198 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIRAP54198 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIRAP54198 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIRAP54198 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIRAP54198 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIRAP54198 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIRAP54198 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIRAP54198 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HIRAP54198 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIRAP54198 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIRAP54198 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIRAP54198 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIRAP54198 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIRAP54198 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIRAP54198 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIRAP54198 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIRAP54198 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIRAP54198 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIRAP54198 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIRAP54198 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HIRAP54198 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIRAP54198 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIRAP54198 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HIRAP54198 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIRAP54198 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIRAP54198 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HIRAP54198 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HIRAP54198 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HIRAP54198 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIRAP54198 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HIRAP54198 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIRAP54198 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIRAP54198 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIRAP54198 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIRAP54198 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HIRAP54198 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIRAP54198 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIRAP54198 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HIRAP54198 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms