Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms