Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms