Protein–RNA interactions for Protein: P39900

MMP12, Macrophage metalloelastase, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP12P39900 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP12P39900 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP12P39900 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP12P39900 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP12P39900 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP12P39900 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP12P39900 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP12P39900 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.1 ms