Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZEB1P37275 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms