Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FLT4P35916 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FLT4P35916 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FLT4P35916 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FLT4P35916 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FLT4P35916 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FLT4P35916 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FLT4P35916 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FLT4P35916 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FLT4P35916 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FLT4P35916 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FLT4P35916 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FLT4P35916 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FLT4P35916 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FLT4P35916 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FLT4P35916 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FLT4P35916 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FLT4P35916 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FLT4P35916 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FLT4P35916 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FLT4P35916 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FLT4P35916 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FLT4P35916 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FLT4P35916 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FLT4P35916 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FLT4P35916 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FLT4P35916 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FLT4P35916 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FLT4P35916 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FLT4P35916 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FLT4P35916 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FLT4P35916 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FLT4P35916 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FLT4P35916 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FLT4P35916 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FLT4P35916 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FLT4P35916 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FLT4P35916 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FLT4P35916 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FLT4P35916 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FLT4P35916 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FLT4P35916 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FLT4P35916 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FLT4P35916 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FLT4P35916 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FLT4P35916 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FLT4P35916 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FLT4P35916 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FLT4P35916 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FLT4P35916 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FLT4P35916 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FLT4P35916 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FLT4P35916 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FLT4P35916 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FLT4P35916 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FLT4P35916 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FLT4P35916 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FLT4P35916 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FLT4P35916 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FLT4P35916 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FLT4P35916 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FLT4P35916 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FLT4P35916 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FLT4P35916 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FLT4P35916 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FLT4P35916 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FLT4P35916 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FLT4P35916 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FLT4P35916 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FLT4P35916 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FLT4P35916 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FLT4P35916 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FLT4P35916 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FLT4P35916 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FLT4P35916 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FLT4P35916 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FLT4P35916 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FLT4P35916 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FLT4P35916 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FLT4P35916 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FLT4P35916 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FLT4P35916 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FLT4P35916 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FLT4P35916 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FLT4P35916 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FLT4P35916 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FLT4P35916 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FLT4P35916 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FLT4P35916 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FLT4P35916 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FLT4P35916 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FLT4P35916 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FLT4P35916 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FLT4P35916 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FLT4P35916 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FLT4P35916 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FLT4P35916 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FLT4P35916 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FLT4P35916 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FLT4P35916 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms