Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms