Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms