Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms