Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
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