Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD1P28340 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD1P28340 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLD1P28340 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLD1P28340 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLD1P28340 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLD1P28340 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLD1P28340 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLD1P28340 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLD1P28340 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLD1P28340 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLD1P28340 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLD1P28340 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
POLD1P28340 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLD1P28340 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLD1P28340 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
POLD1P28340 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLD1P28340 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLD1P28340 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLD1P28340 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLD1P28340 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLD1P28340 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLD1P28340 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLD1P28340 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
POLD1P28340 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLD1P28340 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLD1P28340 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLD1P28340 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLD1P28340 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLD1P28340 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLD1P28340 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLD1P28340 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLD1P28340 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLD1P28340 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLD1P28340 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLD1P28340 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLD1P28340 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLD1P28340 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLD1P28340 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLD1P28340 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLD1P28340 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLD1P28340 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLD1P28340 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLD1P28340 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
POLD1P28340 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLD1P28340 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
POLD1P28340 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLD1P28340 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
POLD1P28340 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
POLD1P28340 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLD1P28340 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLD1P28340 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLD1P28340 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLD1P28340 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD1P28340 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD1P28340 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD1P28340 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD1P28340 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD1P28340 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms