Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms