Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VARSP26640 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VARSP26640 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VARSP26640 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VARSP26640 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VARSP26640 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VARSP26640 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VARSP26640 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VARSP26640 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VARSP26640 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VARSP26640 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VARSP26640 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VARSP26640 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VARSP26640 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VARSP26640 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VARSP26640 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VARSP26640 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VARSP26640 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VARSP26640 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VARSP26640 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VARSP26640 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VARSP26640 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VARSP26640 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VARSP26640 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VARSP26640 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VARSP26640 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VARSP26640 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VARSP26640 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VARSP26640 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VARSP26640 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VARSP26640 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VARSP26640 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VARSP26640 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VARSP26640 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VARSP26640 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms