Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms