Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNNI3P19429 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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TNNI3P19429 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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TNNI3P19429 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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TNNI3P19429 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNNI3P19429 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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