Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-EP13747 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms