Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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