Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms