Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ESRRAP11474 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms